Kamijo adalah seorang siswi di Academy City, tempat orang-orang menggunakan sains untuk mengembangkan kemampuan supranatural. Pria itu sangat penyayang – untungnya bagi seorang biarawati muda bernama Index. Dia sedang dalam pelarian dari perkumpulan penyihir yang menginginkan 103.000 volume pengetahuan sihir yang tersimpan dalam ingatannya. Ketika Index tersandung dalam kehidupan Kamijo, dia menemukan seorang teman dan pelindung yang setia, dan meskipun Kamijo adalah anak terlemah di Academy City, dia memiliki sesuatu yang lain untuknya: Imagine Breaker, kekuatan yang tidak dapat dijelaskan yang tersimpan di tangan kanannya yang meniadakan kekuatan orang lain. Dengan para ilmuwan dan penyihir yang menyerang dari semua sisi, Imagine Breaker pasti akan berguna – tetapi kesetiaan Kamijo kepada Index akan menjadi senjata terhebatnya dalam pertarungan untuk menjaganya tetap aman.
