Banyak insinyur dari seluruh dunia berkumpul di fasilitas kelautan Interpol “Pacific Buoy” di Hachijo-jima, di lepas pantai selatan pantai tengah Prefektur Tokyo, untuk menyaksikan peluncuran sistem baru yang menghubungkan semua sistem kamera penegak hukum di seluruh dunia dan memungkinkan pengenalan wajah di seluruh dunia. Conan, bersama teman-temannya Kogoro, Ran, Agasa, Haibara, dan Detective Boys, juga berangkat ke pulau dengan undangan dari Sonoko untuk melihat paus. Dia menerima pesan dari Subaru, yang mengatakan bahwa seorang agen Europol telah dibunuh di Jerman oleh Gin. Merasa gelisah, Conan menyelinap ke kapal polisi yang dipimpin oleh Kuroda, yang membawa mereka ke pulau untuk melindungi pekerjaan penyelesaian, dan mengunjungi fasilitas baru, tepat pada saat Organisasi Hitam untuk menculik seorang insinyur wanita, mencari sepotong data penting di drive USB-nya. Terdengar suara sekrup yang menakutkan dari laut, saat orang tak dikenal mendekati Haibara.
